Нижняя часть грузовой платформы закрыта оцинкованным листом, предохраняющим деревянный настил пола от негативного воздействия воды и грязи. К основанию крепится наружная обшивка, которая может быть изготовлена из:
- окрашенной оцинкованной стали;
- ламинированной фанеры (толщиной 10 мм);
- плакированного металла (толщиной 0,7 мм).
Герметизация швов промтоварного фургона ГАЗ-3309 достигается за счет применения ленточного герметика в комбинации с силиконом.
Для продовольственных фургонов внутренней обшивкой служит оцинкованная сталь толщиной 0,55 мм. Оцинкованные листы внутренней обшивки ГАЗ-3309 скатаны «в замок», что уменьшает количество отверстий при изготовлении фургона. Также при способе соединения оцинкованных листов «в замок» полностью исключено задирание листов в процессе эксплуатации автофургона. Утеплитель между внутренней и наружной обшивкой — пенополистирол толщиной 25 мм.
Промтоварные автофургоны изготовлены без утеплителя и без внутренней обшивки. Панели и двери внутри фургона ГАЗ-3309 защищены деревянными брусками, предохраняющими внутреннюю часть обшивки от повреждений во время движения автофургона и в период проведения погрузо-разгрузочных работ. Кроме этого они могут быть использованы также для крепления самого груза внутри фургона.
Дверные проемы фургона ГАЗ-3309 окантованы резиновым уплотнителем. На задних распашных дверях с углом открытия 270 градусов применены петли, способные выдерживать значительные нагрузки. Двери фургона в закрытом состоянии упираются в порог пола, что уменьшает разбалтывание дверей во время движения автомобиля.
Кузов автофургона ГАЗ-3309 оборудован внутренним освещением.
По желанию в конструкцию фургона могут быть внесены изменения:
- установка дополнительных боковых дверей, окон и вентиляционных отверстий;
- изменение высоты фургона;
- обивка изнутри ДВП или фанерой;
- оклейка наружной поверхности кузова декоративными пленками для улучшения внешнего вида или для размещения рекламной информации.